Weiterführende Literatur’

Allgemein

• RStudio Cheatsheets → gut gemachte Übersichten der Funktionen in den tidyverse Paketen (auf 1-2 Seiten zusammengefasst)
• R-bloggers → ein Blog mit Neuigkeiten zu den aktuellsten R Entwicklungen und Paketen sowie versch. online tutorials.
• DataCamp → diese Website bietet mittlerweile eine große Bandbreite an R Kursen an, die teilweise umsonst sind.
• Um mehr zu R Operatoren zu lesen ist folgendes Online tutorial empfehlenswert:https://www.tutorialkart.com/r-tutorial/r-operators/.

Visualisierung (v.a. zu ggplot2)

• ggplot2 Dokumentation
  • http://ggplot2.org
  • http://ggplot2.tidyverse.org
• Hilfe erhält man unter: ggplot2 mailing list
• Ein Überblick aller geom_functions: http://ggplot2.tidyverse.org/reference/
• Für einen Überblick an den ggplot theme Komponenten empfiehlt sich Winston Chang’s wiki auf github
• Überblick zu ggplot2 Erweiterungen: http://www.ggplot2-exts.org
• Farbschemen zu ColorBrewer insbesondere für Karten: http://colorbrewer2.org
• Das Stowers Institut hat im ColorChart pdf eine Liste aller möglichen Farben zusammengestellt, welches sehr hilfreich ist.

Geostatistik

• Einen sehr gutes online Buch ist “Geocomputation with R” von Robin Lovelace, Jakub Nowosad und Jannes Muenchow auf der Website https://geocompr.robinlovelace.net/

• Weitere nützliche Pakete werden gut zusammengefasst von den beiden CRAN Task Forces Spatial und SpatioTemporal:
  • https://cran.r-project.org/web/views/Spatial.html
  • https://cran.r-project.org/web/views/SpatioTemporal.html

R Markdown

• Für einen Einstieg siehe auch: R Markdown Webside von R Studio.
• R Studio reference guide.
• Gutes online tutorial: R for fledglings

R Kurs auf Deutsch

Im Rahmen des Lehrlabors der Universität Hamburg gibt es das Projekt R-lab 2.0 welches frei verfügbare online tutorials zu R und swirl Kurse in den Umweltwissenschaften anbietet. Auch das Institut für Marine Ökosystem und Fischereiwissenschaft ist an dem Projekt beteiligt und ein ähnlicher Datenanalyse R Kurs wie dieser wurde auch als swirl Kurs von mir umgesetzt (dieser allerdings auf Englisch).

Allgemein

• Hadley Wickham & Garret Grolemund (2017): R for Data Science, O’Reilly Media Inc., CA, U.S.A, 494p. Online accessible at http://r4ds.had.co.nz/
  → Dieses Buch deckt so ziemlich diesen Kurs ab und stellt DAS tidyverse Nachschlagewerk dar. Man kann es als Druck kaufen oder online (dann umsonst) lesen.

Visualisierung (ggplots)

• Hadley Wickham (2016): ggplot2 - Elegant Graphics for Data Analysis, 2nd edition, Springer International Publishing, Switzerland, 260p. Der Code and Text zu dem Buch kann auch von github runtergeladen werden: https://github.com/hadley/ggplot2-book

• Alboukadel Kassambara (2013): Guide to Create Beautiful Graphics in R, 2nd edition, STHDA, 237p.

Statistische Modellierung

• Michael J. Crawley (2013): The R Book, 2nd edition, Wiley & Sons, Ltd., West Sussex, UK, 975p. An online pdf version is freely available here.
  → This book is very comprehensive (almost 1000p.!) and covers basic statistics as well as many different statistical modelling approaches (which were beyond the scope of this course). However, it does not built on the tidyverse framework so all the graphics are created with the basis packages.

• Alain F. Zuur, Elena N. Ieno, Neil J. Walker, Anatoly A. Saveliev, Graham M. Smith (2009): Mixed Effects Models and Extensions in Ecology with R, Springer Science+Business Media, LLC, NewYork, U.S.A., 574p. Für mehr Information and die Datendateien siehe auch: http://highstat.com
  → Dieses Buch bespricht kurz die einfache linear Regressionen und ihre Limitierung und stellt dann alternative Ansätze in R vor wie GLMs und GAMs (Appendix A ist ein guter Start in die lineare Regression mit R).

Programmierung in R

• Hadley Wickham (2014): Advanced R, Chapman & Hall/CRC The R Series, UK, 456p. Online verfügbar auf: http://adv-r.had.co.nz.
  → Falls Du noch nicht genug bekommen hast von R und richtig in die Programmierwelt eintauchen wills, dann lohnt sich dieses Buch!