Kurseinführung

Data Science 1 - Programmieren & Visualisieren

Saskia Otto

Universität Hamburg, IMF

Wintersemester 2023/2024

Was ist ‘Data Science’?

Aktuell sehr populär!

Quelle: Screenshot der Harvard Business Review Website vom 11. November 2017.

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Das Data Science in Biology Programm

Die DSB Module im Überblick

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Kursstruktur | Präsenz

Interaktive Vorlesungen

  • Web-basierte Vorlesungen (VL)
  • Quizze während der VL (HTML, ArsNova)
  • Paralleles Programmieren (RStudio Workbench, Jupyter)
  • Abschließende Wissensquizze (HTML) als Vorbereitung zur Klausur
  • Hilfreich: Handy, Tablet oder Computer

Übungen

  • Praktische Übungen mittels swirl-Kurs bzw. R Skripten und Notebooks im Rahmen betreuter Gruppenarbeit
  • Angewandte Online-Quizze auf Moodle als weitere Vorbereitung zur Klausur
  • Bearbeitung einer Fallstudie mit abschließender Überprüfung (Moodle)
  • Nötig: Computer oder Tablet

Kursstruktur | Selbststudium

Theorie

  • Vorlesungen als HTML-Dokumente jederzeit verfügbar
    • Mit abschließenden Quizfragen (HTML) als Vorbereitung zur Klausur
  • Screencast der VL (Moodle)

Praxis

  • Praktische Übungen mittels swirl-Kurs bzw. R Skripten und Notebooks im Selbststudium
  • Angewandte Online-Quizze auf Moodle als weitere Vorbereitung zur Klausur
  • Bearbeitung einer Fallstudie mit abschließender Überprüfung (Moodle)

Zu diesem Modul

Lernziele

Am Ende dieses Moduls werdet Ihr…

Vorlesungsthemen - Zeitplan

Termin: Montags, 11:15-12:45, Gr. Hörsaal (MLK 3)

  • Oktober: Data Science Allgemein
    • Einführung in Daten und Datenmanagement
    • Grundlagen der deskriptiven Statistik
    • Biologische Prozesse mathematisch beschreiben
  • November/Dezember: R Programmierung
    • Einführung in die (R) Programmierung
    • Grundlagen in R: Variablen und Vektoren
    • Grundlagen in R: Komplexere Objekte
    • Datenaufbereitung mit tidyverse
    • Datevisualisierung mit base R und ggplot2
    • Maßgeschneiderte ggplot2 Diagramme
  • Januar: Visualisierung
    • Grundlagen der Visualisierung
    • Kartenerstellung mit ggplot und interaktive Grafiken
    • Handhabung spezieller Datentypen
    • Fallbeispiele

Webseite mit Vorlesungsfolien

Aktuelle Kurswebseite: https://uham-bio.github.io/bsc-data-science-1/

Moodle Kurs

MIN Moodle Zugang

  • Übungen
  • Quizfragen
  • VL Screencasts
  • Forum
  • Onlinemeetings

Fallstudien (ab Dezember)

  • Schriftlicher Leistungsnachweis: Bearbeitung einer Fallstudie die frei ausgewählt werden kann.
  • Jede Fallstudie
    • hat ein oder mehrere Datensätze und spezifische Fragen.
    • soll mithilfe einer umfangreichen Datenanalyse in R bearbeitet werden.
  • Abgabe:
    • R Skript
    • Kurzbericht (MS Word, Libreoffice Writer)
  • Abschlussfragebogen auf Moodle

Weitere Infos gibt es auf Moodle.

Übersicht zu den Übungen

Gruppenzeiten

Gruppe Tag Zeit Ort BSc Betreuung
A Mo 14:00-15:30 IZS, gr. HS BIO Dr. Saskia Otto
B Mo 14:00-15:30 IZS, Kosswig-HS BIO Marie-Christin Hardenbricker
C Mi 11:00-12:30 IPM, CvL-HS BIO Marie-Christin Hardenbricker
D Mi 11:00-12:30 IPM, E.004 BIO Dirk Granse
E Mi 15:15-16:45 IZS, 017 BIO Prof. Dr. Kathrin Otte
F Mi 15:15-16:45 IZS, Kosswig-HS BIO Dr. Monika Eberhard
G Mi 15:30-17:00 IPM, E.303 BIO Andrea-Carolin Menzel
H Do 15:30-17:00 IPM, CvL-HS BIO Dirk Granse
I Do 14:15-15:45 IZS, Kosswig-HS BIO Marie-Christin Hardenbricker
J Mi 15:30-17:00 IPM, E.304 BIO Prof. Dr. Jochen Fründ
K Do 14:15-15:45 IZS, gr. HS BIO Prof. Dr. Kathrin Otte
L Mi 13:15-14:45 IMF/GES, 107 BMARSYS Dr. Saskia Otto

Buchempfehlungen

Hier ein paar Vorschläge…

Ready for the jump?

Quelle: www.pixabay.com (CCO 1.0 Lizenz)

Bei weiteren Fragen: saskia.otto(at)uni-hamburg.de

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